Laistymas yra viena iš pagrindinių bonsai augalų valdymo užduočių. Laistyti atrodo paprasta, bet nelengva tinkamai laistyti. Laistymas turėtų būti atliekamas atsižvelgiant į augalų rūšį, sezoninius pokyčius, augimo periodą, žydėjimo laikotarpį, ramybės periodą ir augalo oro sąlygas. Laistymo laiko ir kiekio įsisavinimas yra labai svarbus augalų augimui. Kai kurių bonsų augalų mirtis yra tiesiogiai susijusi su netinkamu laistymu.

Vazoninė žemė ne tik aprūpina vazoninius augalus vandeniu ir maistinėmis medžiagomis, bet ir palaiko normalų augalų kvėpavimą oru. Kai vazono žemėje pakanka drėgmės, žemės dalelės plečiasi, išspausdamos orą tarp dalelių tarpuose, todėl vazono žemėje trūksta oro; vazoninei žemei išdžiūvus arba sąlyginai išdžiūvus, dirvos dalelės susitraukia, sumažėja tūris, vėl atsiranda tarpai tarp dalelių. Tarpai užpildyti oru.

Kai dirva keičiasi iš sausos ir drėgnos, oras vazono žemėje taip pat nuolat cirkuliuoja, todėl augalų šaknys gali normaliai kvėpuoti. Po kiekvieno laistymo augalo šaknys per trumpą laiką ištvers deguonies trūkumą vazono dirvoje. Tačiau jei vazono žemė ilgą laiką bus per drėgna, dėl to ilgai trūks deguonies, tai sukels šaknų eroziją ir kitas ligas; Jei dirva ilgai išdžiūvo, nors vazono žemėje pakanka deguonies, augalai ilgą laiką negali įsisavinti vandens, o tai taip pat kenkia augalų augimui ir netgi gali sukelti jų mirtį. Todėl laistant bonsų augalus reikia laikytis principo „nelaistykite, kai jie išdžiūvę, laistykite gerai“.

Dėl nepakankamo augalų laistymo ir dehidratacijos šakelės nuvys ir nukris, o lapai nuvys, pagels ir nukris. Spygliuočių rūšių atveju spygliai taps minkšti ir praras tvirtą bei dygliuotą pojūtį. Esant dideliam vandens trūkumui, šakelių žievė susitraukia kaip žąsies oda. Jei susiduriate su tokia situacija vasarą, nedelsdami perkelkite augalą į tamsesnę vietą. Temperatūrai nukritus, pirmiausia apipurkškite lapus vandeniu, tada į puodą įpilkite šiek tiek vandens, o po valandos gerai supilkite vandenį.

Stipriai išsausėjusius augalus būtinai iš karto nelaistykite pakankamai, nes kai augalas smarkiai išsausėja, šaknų žievė susitraukė ir yra arti ksilemo. Jei staiga tiekiamas didelis vandens kiekis, dėl greito vandens įsisavinimo išsiplės šaknų sistema, sukels žievės plyšimą, dėl ko augalas miršta, todėl reikia laipsniško adaptacijos proceso. Po to, kai augalai, kuriems labai trūksta vandens, yra apdorojami aukščiau, keletą dienų geriausia juos palaikyti pavėsyje, o tada, kai jie sustiprėja, auginti saulėje. Tačiau neperlaistykite. Be to, kad augalai staigiai auga, turi įtakos medžio formai ir dekoratyvinei vertei, per didelis laistymas taip pat gali lengvai sukelti šaknų puvinį ir mirtį. Miniatiūriniai bonsų vazonai reikalauja mažiau dirvožemio, todėl ypač svarbu juos palaistyti tinkamu laiku ir reikiamu kiekiu.