Laistymas yra viena iš pagrindinių bonsai augalų priežiūros užduočių. Laistymas atrodo paprastas, tačiau tinkamai palaistyti nėra lengva. Laistyti reikia atsižvelgiant į augalo rūšį, sezoninius pokyčius, augimo periodą, žydėjimo periodą, ramybės periodą ir oro sąlygas. Laistymo laiko ir kiekio įvaldymas yra labai svarbus augalų augimui. Kai kurių bonsai augalų žūtis yra tiesiogiai susijusi su netinkamu laistymu.

Be to, kad vazoniniai augalai gauna vandens ir maistinių medžiagų, vazoninis dirvožemis taip pat palaiko normalų augalų kvėpavimą oru. Kai vazoninis dirvožemis yra pakankamai drėgnas, dirvožemio dalelės išsiplečia, išstumdamos orą iš tarpų tarp dalelių, todėl dirvožemyje trūksta oro; kai vazoninis dirvožemis yra sausas arba santykinai sausas, dirvožemio dalelės susitraukia, sumažėja jų tūris ir vėl atsiranda tarpų tarp dalelių. Tarpai užpildomi oru.

Kadangi dirvožemis keičiasi tarp sausos ir drėgnos būsenos, oras vazono žemėje taip pat nuolat cirkuliuoja, todėl augalo šaknys gali normaliai kvėpuoti. Po kiekvieno laistymo augalo šaknys per trumpą laiką gali toleruoti deguonies trūkumą vazono žemėje. Tačiau jei vazono žemė ilgą laiką bus per drėgna ir dėl to ilgai trūks deguonies, tai sukels šaknų eroziją ir kitas ligas; jei dirvožemis ilgą laiką bus sausas, nors vazono žemėje yra pakankamai deguonies, augalai ilgą laiką negalės sugerti vandens, o tai taip pat kenkia augalų augimui ir netgi gali sukelti jų žūtį. Todėl laistant bonsai augalus reikėtų laikytis principo „nelaistykite jų sausų, palaistykite juos gausiai“.

Nepakankamas augalų laistymas ir džiovinimas lemtų šakelių vytimą ir nulinkimą, o lapai – nudžiūvimą, gelsvėjimą ir nukrisimą. Spygliuočių medžių spygliai suminkštės ir praras savo tvirtumą bei dygumą. Esant dideliam vandens trūkumui, šakelių žievė susitraukia kaip žąsies oda. Jei su tuo susiduriate vasarą, nedelsdami perkelkite augalą į pavėsingą vietą. Kai temperatūra nukrenta, pirmiausia apipurkškite lapus vandeniu, tada įpilkite šiek tiek vandens į vazoną ir po valandos kruopščiai perpilkite vandenį.

Labai dehidratuotų augalų nelaistykite iš karto, nes labai dehidratavus augalui šaknų žievė susitraukia ir yra arti ksilemo. Staiga tiekiant daug vandens, šaknų sistema išsiplečia dėl greito vandens absorbcijos, žievė plyšta ir augalas žūsta, todėl reikalingas laipsniškas prisitaikymo procesas. Po to, kai augalai, kuriems labai trūksta vandens, yra apdorojami minėtu būdu, geriausia juos kelias dienas palaikyti pavėsyje, o tada, kai jie sustiprėja, auginti saulėje. Tačiau neperlaistykite. Per didelis laistymas ne tik skatina augalų staigų augimą, paveikia medžio formą ir dekoratyvinę vertę, bet ir lengvai gali sukelti šaknų puvinį bei žūtį. Miniatiūriniams bonsai vazonams reikia mažiau dirvožemio, todėl ypač svarbu juos laistyti tinkamu laiku ir tinkamu kiekiu.